Tezaure valoroase din antichități au dispărut pentru totdeauna în Transilvania în timpul domniei habsburgilor. Printre acestea se numără vestigii din Băile Herculane și colecții de antichități din Ulpia Traiana Sarmizegetusa.
Obiectele de artă și culturale au fost transportate la Viena de către habsburgi, dar nu toate au ajuns acolo, unele dispărând pe drum. Ruinele stațiunii Ad Mediam din Băile Herculane au fost descoperite în secolul al XVIII-lea, dezvăluind temple, băi antice, un amfiteatru și monumente închinate zeilor Hercules, Esculap și Higeea.
În Banat, s-au descoperit antichități romane în timpul restaurării băilor termale de la Mehadia. Multe dintre aceste bogății istorice au fost transportate la Viena, dar unele corăbii s-au scufundat pe drum, pierzându-se pentru totdeauna.
Colecțiile de vestigii antice din Ulpia Traiana Sarmizegetusa și Alba Iulia au suferit aceeași soartă. Unele au fost pierdute în Dunăre, altele s-au scufundat în Mureș. Nobilul Josephus Ariosti a contribuit la epigrafia Daciei, copiind inscripții și piese sculpturale romane pentru a le trimite la Viena.
Numeroase bătălii navale pe Dunăre au dus la pierderea unor comori valoroase din Transilvania. Navele care le transportau au fost scufundate împreună cu aceste tezaure antice.